RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 VWA8A3KMH1 1905 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 WDR27A2RRH5 827 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 PRR33A8MZF0 331 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 NCAM2O15394 837 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 DAPK3O43293 454 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 TLL1O43897 1013 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CD48P09326 243 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CSH1P0DML2 217 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CSH2P0DML3 217 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ACRP10323 421 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 KLRC2P26717 231 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CCR1P32246 355 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 OR1D2P34982 312 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 KCNJ1P48048 391 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ROR1Q01973 937 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ADCY2Q08462 1091 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 SEMA3BQ13214 749 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 NME3Q13232 169 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 PLD1Q13393 1074 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 SLMAPQ14BN4 828 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 DDR2Q16832 855 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 GSTA5Q7RTV2 222 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 FAM131BQ86XD5 332 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC185Q8N715 623 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 PQLC3Q8N755 202 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 SCAMP5Q8TAC9 235 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ATG4AQ8WYN0 398 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 FBXO32Q969P5 355 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 RTP4Q96DX8 246 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf74Q96LT6 269 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 FMO2Q99518 471 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM51Q9BSJ1 452 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 VN1R3Q9BXE9 311 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 PHACTR1Q9C0D0 580 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 PIGVQ9NUD9 493 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 HCSTQ9UBK5 93 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 DNPEPQ9ULA0 475 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.15□□□□□ -0.78
POLR1A-202ENST00000409024 REV3LO60673 3130 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 SLC38A8A6NNN8 435 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ZBBXA8MT70 800 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 LILRB3O75022 631 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 VNN2O95498 520 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 KRT14P02533 472 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 MYBL2P10244 700 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CTSAP10619 480 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RBP3P10745 1247 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 IVDP26440 423 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ECHS1P30084 290 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ADCY8P40145 1251 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RPL21P46778 160 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ALDH1A3P47895 512 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TUBP50607 506 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ARPP19P56211 112 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 NHLH1Q02575 133 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 UBE3AQ05086 875 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RING1Q06587 406 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF33AQ06730 810 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 DUSP4Q13115 394 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CBLBQ13191 982 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 SNX1Q13596 522 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CA9Q16790 459 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RAB6CQ53S08 254 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CFAP58Q5T655 872 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 KLHDC10Q6PID8 442 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TAC4Q86UU9 113 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RELL1Q8IUW5 271 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms