RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397906.6

TTC28-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28, Length 11,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-201ENST00000397906 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PARNO95453 639 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 DNAJC3Q13217 504 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 TADA1Q96BN2 335 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 TSC22D3Q99576 134 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 MSCO60682 206 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SLURP2P0DP57 97 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 AMPD1P23109 780 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 RARRES1P49788 294 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SEC23AQ15436 765 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 DEFB106AQ8N104 65 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SGSM3Q96HU1 749 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 INTS13Q9NVM9 706 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SPATA20Q8TB22 786 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 WDR27A2RRH5 827 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 IL1BP01584 269 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 NFICP08651 508 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CCR4P51679 360 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CES3Q6UWW8 571 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PTPN3P26045 913 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 TGM3Q08188 693 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 DMTNQ08495 405 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 LRRC6Q86X45 466 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SLC5A5Q92911 643 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 IQGAP1P46940 1657 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 TIMM44O43615 452 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 MAPK1P28482 360 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CASP10Q92851 521 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ATP6V1C1P21283 382 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 KLHL2O95198 593 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SENP8Q96LD8 212 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 MROH2AA6NES4 1674 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 B2RBV5 119 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CABYRO75952 493 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 AMD1P17707 334 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 E5RJQ4 531 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SERPINB4P48594 390 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 COMMD2Q86X83 199 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 KCNK1O00180 336 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 OTOP2Q7RTS6 562 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 P3H2Q8IVL5 708 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 MEI4A8MW99 385 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 FMO4P31512 558 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 HIPK3Q9H422 1215 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 DCCP43146 1447 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ACKR2O00590 384 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 OR56A5P0C7T3 313 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 GRIK5Q16478 980 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 FLCNQ8NFG4 579 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 155.6
TTC28-201ENST00000397906 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SLC2A4P14672 509 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 KLF15Q9UIH9 416 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 SMAPO00193 183 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 ADCY6O43306 1168 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-201ENST00000397906 MAP2K5Q13163 448 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms