RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 LRP3O75074 770 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GBP1P32455 592 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 MYL5Q02045 173 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 NNTQ13423 1086 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF5Q15542 800 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PGBD3Q8N328 593 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 LOXL4Q96JB6 756 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP83Q9Y592 693 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 THADAQ6YHU6 1953 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCA7Q8IZY2 2146 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP11B1P15538 503 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC6A4P31645 630 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 KLK7P49862 253 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SGSHP51688 502 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ELF2Q15723 593 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC39A13Q96H72 371 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRG3Q99928 467 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 STK33Q9BYT3 514 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GANQ9H2C0 597 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PQF6 199 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 F8VZ95 297 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 EPN2O95208 641 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ERBB2P04626 1255 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ID4P47928 161 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 LMNB2Q03252 620 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TYRO3Q06418 890 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 UCMAQ8WVF2 138 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 RLN3Q8WXF3 142 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 AZIN2Q96A70 460 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 RMDN1Q96DB5 314 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNCQ9H7C4 482 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD54BQ9Y620 910 aa21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 WASH3PC4AMC7 463 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 IRAK2O43187 625 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TBL1XO60907 577 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GRAP2O75791 330 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 RHOBTB1O94844 696 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GLI1P08151 1106 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRG2P18507 467 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 BCKDHBP21953 392 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX16P57768 344 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CSRP2Q16527 193 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF6Q58WW2 860 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF3Q5VWG9 929 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf74Q86VG3 221 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 DEFB106AQ8N104 65 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CIPCQ9C0C6 399 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.02■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 HSF2BPO75031 334 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 IGLV3-25P01717 112 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 APOEP02649 317 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-FP30511 346 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 P2RY2P41231 377 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 NCAPHQ15003 741 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC6Q16204 474 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 PMS2CLQ68D20 193 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.01■□□□□ 0.95
ANKRD39-201ENST00000393537 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms