RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HMX3A6NHT5 357 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PIK3CDO00329 1044 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 VILLO15195 856 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SCO2O43819 266 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PTP4A3O75365 173 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 MED24O75448 989 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HAUS5O94927 633 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TPBGLP0DKB5 382 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC9A1P19634 815 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 BMPR1AP36894 532 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 ACAP2Q15057 778 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TMC8Q8IU68 726 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPYL6Q8N831 410 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FANCBQ8NB91 859 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HPS1Q92902 700 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FERMT2Q96AC1 680 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM47Q96LD4 638 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 AK8Q96MA6 479 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RANBP9Q96S59 729 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KIFC1Q9BW19 673 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PINK1Q9BXM7 581 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PADI4Q9UM07 663 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 F8W8V4 182 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GCATO75600 419 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT6AP02538 564 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT6BP04259 564 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 BTDP43251 543 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK7P50613 346 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DSG2Q14126 1118 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.281e-5■□□□□ 8.3
RABGEF1-202ENST00000380828 STX1AQ16623 288 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP55Q53EZ4 464 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CHADLQ6NUI6 762 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT13Q86X67 352 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 IL17REQ8NFR9 667 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52N1Q8NH53 320 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CRELD1Q96HD1 420 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 STMN3Q9NZ72 180 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT19A8MXV4 375 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF4O00268 1085 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TOR1AO14656 332 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCY6O43306 1168 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TGM1P22735 817 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.293e-7■■■□□ 15.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 PDE1AP54750 535 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC6Q86X45 466 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MICALL2Q8IY33 904 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 OXR1Q8N573 874 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 OXER1Q8TDS5 423 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 FBF1Q8TES7 1133 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CHFRQ96EP1 664 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MEGF6O75095 1541 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.02□□□□□ -1.29
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