RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMRN2Q9H8L6 949 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL17RBQ9NRM6 502 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DUSP22Q9NRW4 184 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLC4Q9NSK0 619 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 AASSQ9UDR5 926 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GABRQQ9UN88 632 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAMK2AQ9UQM7 478 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LMTK3Q96Q04 1460 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3EA0A087X179 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PPH5 198 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIPSLA2A3N6 862 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3BA6NDS4 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB13A6NJU9 1138 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB5A8MRT5 1133 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 A8MVJ9 347 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 EFCAB8A8MWE9 144 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 B4E171 279 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3LB9A6J9 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB4C9JG80 1138 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMD9O00233 223 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FYB1O15117 783 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NKX2-8O15522 239 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOC3O60645 756 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3HP0C7X1 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 APEHP13798 732 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHN1P15882 459 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 XBP1P17861 261 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELF1P32519 619 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT9P35527 623 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS2P41220 211 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOLR3P41439 243 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPAN7P41732 249 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RXRGP48443 463 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGTR2P50052 363 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLE2P56282 527 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NXPH1P58417 271 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TLE2Q04725 743 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNASE1L3Q13609 305 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCTN1Q14203 1278 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT32Q14532 448 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSTQ16762 297 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC45A4Q5BKX6 768 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACSM6Q6P461 480 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6YL49 198 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DBX2Q6ZNG2 339 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTCHD4Q6ZW05 846 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASAL3Q86YV0 1011 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNTROBQ8N137 903 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS52Q8N1B4 723 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD52Q8NB46 1076 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RSC1A1Q92681 617 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF125Q96EQ8 232 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR78Q96P69 363 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SENP7Q9BQF6 1050 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNK9Q9NPC2 374 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASIC5Q9NY37 505 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MGAT4CQ9UBM8 478 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 HDAC6Q9UBN7 1215 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO4Q9UKT5 387 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FZD1Q9UP38 647 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRID2IPA4D2P6 1211 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 A6NCN8 305 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 C17orf100A8MU93 164 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRYO14603 147 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF213O14771 459 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 URI1O94763 535 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LARGE1O95461 756 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TFRCP02786 760 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LDHCP07864 332 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DRD4P21917 467 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAPK4P31152 587 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADRA1BP35368 520 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPLP40238 635 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 STAT6P42226 847 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 HARS2P49590 506 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 JAK3P52333 1124 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CASP6P55212 293 aa2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms