RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333090.4

TSKU-201, Transcript of tsukushi, small leucine rich proteoglycan, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSKU, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKU-201ENST00000333090 PCYT2Q99447 389 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SERPINE1P05121 402 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CHN2P52757 468 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 XIAPP98170 497 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PCLAFQ15004 111 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TMEM192Q8IY95 271 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ICA1LQ8NDH6 482 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ATP2A3Q93084 1043 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 GCNAQ96QF7 691 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 BTBD7Q9P203 1132 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 GLRA3O75311 464 aa24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 VAV1P15498 845 aa24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 BTKQ06187 659 aa24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SORT1Q99523 831 aa24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.33■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 WDR27A2RRH5 827 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 B4GALT4O60513 344 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 CILPO75339 1184 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ARRB2P32121 409 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 RANBP1P43487 201 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 FOLH1Q04609 750 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 FAM81AQ8TBF8 368 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 CAPN8A6NHC0 703 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 DCXO43602 365 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 CREB3O43889 395 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 CNTFP26441 200 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 STXBP2Q15833 593 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 CCDC14Q49A88 953 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 BOLA3Q53S33 107 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 MIS12Q9H081 205 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ACAD9Q9H845 621 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 E2F8A0AVK6 867 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 PYGLP06737 847 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 RGS7P49802 495 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 STAT5BP51692 787 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 GBE1Q04446 702 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 DBN1Q16643 649 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 DLK2Q6UY11 383 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 FBXW8Q8N3Y1 598 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 PACSIN3Q9UKS6 424 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.32■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 B4GALT5O43286 388 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ITGB3P05106 788 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 NFICP08651 508 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 GMPRP36959 345 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 HMGCS2P54868 508 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 UGT2A3Q6UWM9 527 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ZBTB7AO95365 584 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 PPM1JQ5JR12 505 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 HIC2Q96JB3 615 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 HACL1Q9UJ83 578 aa24.31■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 H3BNX3 289 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 PACS1Q6VY07 963 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 DTNAQ9Y4J8 743 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 PSAT1Q9Y617 370 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 TPSB2P20231 275 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 BACE1P56817 501 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 MAP7Q14244 749 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 TPSAB1Q15661 275 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ARMC3Q5W041 872 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 ACMSDQ8TDX5 336 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.3■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.29■■□□□ 1.48
TSKU-201ENST00000333090 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms