RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 GPAMQ9HCL2 828 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 EMCNQ9ULC0 261 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CIB2O75838 187 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 GRIA1P42261 906 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 TUBB3Q13509 450 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 LAMC2Q13753 1193 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 KRT82Q9NSB4 513 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K7O43318 606 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 VTNP04004 478 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 C6orf163Q5TEZ5 329 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.25■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SYT15Q9BQS2 421 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.24■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB7AO95365 584 aa23.24■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 VAV1P15498 845 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PACS1Q6VY07 963 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 STRADAQ7RTN6 431 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 DTX3LQ8TDB6 740 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CDKL2Q92772 493 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PANX3Q96QZ0 392 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 NAT9Q9BTE0 207 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 VCXQ9H320 206 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 MROH8Q9H579 483 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SLC7A8Q9UHI5 535 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ASB14A6NK59 587 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PLIN3O60664 434 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CAPN15O75808 1086 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 KITP10721 976 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CPOXP36551 454 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 TUBP50607 506 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP8P85298 464 aa23.23■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 TMEM154Q6P9G4 183 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF778Q96MU6 729 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 WDR27A2RRH5 827 aa23.23■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 KDSRQ06136 332 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB6Q15916 424 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 GSTA3Q16772 222 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 INSCQ1MX18 579 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa23.23■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 EBF4Q9BQW3 602 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 DCDC2Q9UHG0 476 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SOX13Q9UN79 622 aa23.23■■□□□ 1.31
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HOXD1-201ENST00000331462 ADORA2AP29274 412 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 BCAT1P54687 386 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 GPC2Q8N158 579 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC185Q8N715 623 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP7Q8WX94 980 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SNX27Q96L92 541 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ASB3Q9Y575 518 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SCN1AP35498 2009 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINE1P05121 402 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 MYL4P12829 197 aa23.21■■□□□ 1.31
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