RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.74■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 CREB3O43889 395 aa24.74■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 SCNN1GP51170 649 aa24.74■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 DAOAP59103 153 aa24.74■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 SERINC5Q86VE9 423 aa24.74■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 SH2D5Q6ZV89 423 aa24.73■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.73■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC9A7Q96T83 725 aa24.73■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 SMYD2Q9NRG4 433 aa24.73■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.72■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 APBB2Q92870 758 aa24.72■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 NTAN1Q96AB6 310 aa24.72■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 P2RY11Q96G91 374 aa24.72■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 SPC25Q9HBM1 224 aa24.72■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.72■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 C9IYK1 514 aa24.71■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 E7ENQ6 273 aa24.71■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 HGSO14964 777 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 GPR182O15218 404 aa24.71■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.71■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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TRIM54-201ENST00000296098 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.71■■□□□ 1.55
TRIM54-201ENST00000296098 COPEO14579 308 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 DCLK1O15075 740 aa24.7■■□□□ 1.54
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