RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ING5Q8WYH8 240 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC19Q9H756 370 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TJP3O95049 919 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBX18O95935 607 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FNTAP49354 379 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SULT1E1P49888 294 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TXNDC8Q6A555 127 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCTD6Q8NC69 237 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSPH1Q92598 858 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NT5C3BQ969T7 300 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPY6RQ99463 290 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2orf78A6NCI8 922 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNFRSF8P28908 595 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DR1Q01658 176 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEAD2Q15562 447 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF6Q58WW2 860 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CES5AQ6NT32 575 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POTEHQ6S545 545 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFT20Q8IY31 132 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GDF3Q9NR23 364 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD207Q9UJ71 328 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM187AA6NFU0 413 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MDM4O15151 490 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ENDOD1O94919 500 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RARGP13631 454 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT10P13645 584 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEBPBP17676 345 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC25CP30307 473 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COILP38432 576 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATAT1Q5SQI0 421 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BNIPLQ7Z465 357 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCLK3Q9C098 648 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRN3Q9NYV6 651 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAPN9O14815 690 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTI1O43156 1089 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCAM1P13591 858 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARSEP51690 589 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GUCY2DQ02846 1103 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDK2Q15119 407 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KAZNQ674X7 775 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTC27Q6P3X3 843 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLA-CQ95604 372 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GCNAQ96QF7 691 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC22A12Q96S37 553 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLR5O60602 858 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTGIRP43119 386 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDH6P55285 790 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCNG2Q16589 344 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP9Q49MG5 647 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BEND5Q7L4P6 421 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LEMD2Q8NC56 503 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAM32Q8TC27 787 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLUHO75153 1309 aa21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms