RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SPATA13Q96N96 652 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.859e-10■□□□□ 10.4
RTKN-201ENST00000233330 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 HHLA1C9JL84 531 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CAPN9O14815 690 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 TM9SF1O15321 606 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CREB3O43889 395 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 MT-ND3P03897 115 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SLC20A2Q08357 652 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 DPYSQ14117 519 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.35■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 GSTA2P09210 222 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 ADRA1DP25100 572 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PCSK1P29120 753 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 AIF1P55008 147 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 ADAM32Q8TC27 787 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 NTAN1Q96AB6 310 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SERAC1Q96JX3 654 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 GGT7Q9UJ14 662 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 APOEP02649 317 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 USP17L7P0C7H9 530 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 ADRA1BP35368 520 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 GRIA1P42261 906 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 GLUD2P49448 558 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 RAB27AP51159 221 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 RFX8Q6ZV50 586 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 LRRC6Q86X45 466 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 MPP5Q8N3R9 675 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PPM1NQ8N819 430 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 NETO2Q8NC67 525 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.34■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 I3L4J1 428 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 UBOX5O94941 541 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 POMCP01189 267 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 ODC1P11926 461 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 FDFT1P37268 417 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PRKCZQ05513 592 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 SCAPQ12770 1279 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 DSC3Q14574 896 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PDK1Q15118 436 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 KCNA10Q16322 511 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 RNF43Q68DV7 783 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 MYLPFQ96A32 169 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 P2RY11Q96G91 374 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.33■□□□□ 0.85
RTKN-201ENST00000233330 BRCA2P51587 3418 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 HTTP42858 3142 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 A0A0U1RQF3 1178 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 I6L893 689 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 RNF103O00237 685 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 DCLK1O15075 740 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 RASSF9O75901 435 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FAM155BO75949 473 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 LTFP02788 710 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 NCAM1P13591 858 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SLC18A2Q05940 514 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 MGAT5Q09328 741 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 AP1B1Q10567 949 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ZNF276Q8N554 614 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CCDC63Q8NA47 563 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms