RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IvlP48997 467 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CenpcP49452 906 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab33aP97950 237 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trappc9Q3U0M1 1148 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pank2Q3U4S0 443 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ceacam5Q3UKK2 947 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Syne3Q4FZC9 975 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pik3r5Q5SW28 871 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf821Q6PD05 413 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adcy2Q80TL1 1090 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Creb3l2Q8BH52 521 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nlrp10Q8CCN1 673 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd209bQ8CJ91 325 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elmod3Q91YP6 381 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcg3Q99P81 650 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndufb5Q9CQH3 189 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mgrn1Q9D074 532 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spata17Q9D552 379 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adam23Q9R1V7 829 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd2Q9WV06 328 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcna10B2RQA1 511 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Speer4f2E9Q366 295 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm1758F6VZZ1 202 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mroh9G5E8L9 891 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myl4P09541 193 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AxlQ00993 888 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klra5Q60652 266 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb17Q60821 794 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ldlrap1Q8C142 308 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sytl2Q99N50 950 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttc33Q9D6K7 262 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eef1akmt2Q9D853 244 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700069L16RikQ9D9H5 109 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcg8Q9DBM0 673 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nfu1Q9QZ23 255 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Glipr1l3A0A1W2P7V2 236 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rad51ap2G3UW63 976 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pim1P06803 397 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LifP09056 203 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc1a1P51906 523 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxr1Q3UTB7 268 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm29609Q3UU56 907 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpinb6Q60854 378 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TCAIMQ66JZ4 499 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OcrlQ6NVF0 900 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpatch2lQ6PE65 482 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gtf3c2Q8BL74 907 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il36gQ8R460 164 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf34Q99KR6 376 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dbndd2Q9CRD4 158 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mis12Q9CY25 206 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DmgdhQ9DBT9 869 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr711Q9EPG2 314 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spry1Q9QXV9 313 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 9230113P08RikD3YWX3 137 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adamtsl5D3Z689 485 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpinb9O08797 374 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 JundP15066 341 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SykP48025 629 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PrlrQ08501 608 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MyzapQ3UIJ9 466 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr26Q7TRB7 308 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr867Q7TRF3 331 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fnbp1Q80TY0 616 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sit1Q8C503 180 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup58Q8R332 587 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc65Q8VHI7 493 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc17Q9CXD9 443 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifi35Q9D8C4 286 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam3aQ9D8T0 230 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr933Q9EQA0 308 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IvdQ9JHI5 424 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scube2Q9JJS0 997 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psmg1Q9JK23 289 aa22.62■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scn8aQ9WTU3 1978 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13090A2A899 111 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nhsl2B1AXH1 854 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap42B2RQE8 841 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam71aB7XG49 585 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp850J3QPC5 689 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ring1O35730 406 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Becn1O88597 448 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfy2P20662 777 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rasgrf1P27671 1262 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brms1lQ3U1T3 323 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zdhhc5Q8VDZ4 715 aa22.61■■□□□ 1.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PawrQ925B0 333 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.6 ms