RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ifi205aQ8CGE8 404 aa16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Taf10Q8K0H5 218 aa16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dydc1Q9D9T0 175 aa16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cog1Q9Z160 980 aa16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pex11bQ9Z210 259 aa16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rp1P56716 2095 aa16.64■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc8D3YZV8 685 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 E230025N22RikG5E8S3 482 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif3cO35066 796 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pdk4O70571 412 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptger1P35375 405 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Timm13P62075 95 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Msx3P70354 204 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp8a1P70704 1164 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt80Q0VBK2 452 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pla2g4dQ50L43 825 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt42Q6IFX2 452 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sec23ipQ6NZC7 998 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tas2r102Q7M717 329 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam185aQ7TPD2 378 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Orai2Q8BH10 250 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gsto2Q8K2Q2 248 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim60Q8VI40 466 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fads1Q920L1 447 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lysmd3Q99LE3 305 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 QpctQ9CYK2 362 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 ArskQ9D2L1 553 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 PgcQ9D7R7 392 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Magel2Q9QZ04 1284 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rhox3cA2AWM0 215 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Skint6A7XUZ6 1240 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim30cD3YVI9 513 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930558K02RikE0CXC6 182 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm5795E9PZN8 263 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcdh9F8VPK8 1237 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rhox3hL7MU37 215 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm7995L7N2E4 160 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ess2O70279 479 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 SrgnP13609 152 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Itga1Q3V3R4 1179 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psg28Q4KL66 472 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rhox3aQ4TU90 215 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem199Q5SYH2 208 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lilrb4Q64281 335 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Enpp3Q6DYE8 874 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nod1Q8BHB0 953 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fbxw7Q8VBV4 629 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gimap4Q99JY3 219 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abcg3Q99P81 650 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr711Q9EPG2 314 aa16.63■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cntnap3E9PY62 1287 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kcng2F7A6P6 480 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rab20P35295 233 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Emilin3P59900 758 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fez2Q6TYB5 348 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem169Q8BG50 297 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trpa1Q8BLA8 1125 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bicd1Q8BR07 835 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnali1Q8BVN8 258 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Efcab8Q8C9R9 203 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spdye4bQ8CDE8 236 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fbxo21Q8VDH1 627 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp617Q91WM0 559 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 TrabdQ99JY4 376 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ly6kQ9CWP4 154 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Thg1lQ9CY52 298 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snf8Q9CZ28 258 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 ParvbQ9ES46 365 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 PignQ9R1S3 931 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep350E9Q309 3095 aa16.62■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 MgamB5THE2 1827 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r111K7N674 857 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r39L7N2E5 861 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fgf18O89101 207 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 St3gal1P54751 337 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sdr16c6Q05A13 316 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rgs9bpQ148R9 237 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adad1Q5SUE7 619 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nrg1Q6DR99 700 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rxfp1Q6R6I7 758 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gpr20Q8BYC4 358 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q8CDN1 933 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tti1Q91V83 1085 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smc6Q924W5 1097 aa16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.1 ms