RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 AFMP43652 599 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PSEN1P49768 467 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN10P78369 228 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 EFEMP1Q12805 493 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZACNQ401N2 412 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SHC4Q6S5L8 630 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH9Q86YJ5 346 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SORCS1Q8WY21 1168 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TWNKQ96RR1 684 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PNPLA8Q9NP80 782 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ELOVL2Q9NXB9 296 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 COG7P83436 770 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SCD5Q86SK9 330 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5C1AQ9BXI3 368 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 IMPG2Q9BZV3 1241 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ASS1P00966 412 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DRAP01903 254 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CD58P19256 250 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF11P52732 1056 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 COPAP53621 1224 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4F3Q08477 520 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CUL4BQ13620 913 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ENPP2Q13822 863 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SV2AQ7L0J3 742 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC186Q7Z3E2 898 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT15Q8N3T1 639 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DDI1Q8WTU0 396 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SCUBE2Q9NQ36 999 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TOR4AQ9NXH8 423 aa28.71■■■□□ 2.19
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CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD3Q9Y2F9 522 aa28.71■■■□□ 2.19
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CAPNS1-217ENST00000629983 TEAD4Q15561 434 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP135Q66GS9 1140 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND1CQ8IV53 801 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAI2Q9GZS0 605 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 STRIP2Q9ULQ0 834 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMA5O15230 3695 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV3-19P01714 112 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF19Q2TAC6 998 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LHX5Q9H2C1 402 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DMAC2Q9NW81 257 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC4EQ9ULY5 219 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX11Q9Y5W9 270 aa28.69■■■□□ 2.18
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM149AA5PLN7 773 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TRABD2BA6NFA1 517 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-EP13747 358 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 INCA1Q0VD86 236 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T3Q8NH03 318 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC2Q8TDI7 906 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PCED1AQ9H1Q7 454 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC1Q9NV70 894 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM13BQ9NYF5 915 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC12A8A0AV02 714 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 YEATS4O95619 227 aa28.67■■■□□ 2.18
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A9Q8IVB4 645 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH2Q9P0N8 246 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DKK4Q9UBT3 224 aa28.67■■■□□ 2.18
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa28.67■■■□□ 2.18
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CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM44O43615 452 aa28.65■■■□□ 2.18
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CAPNS1-217ENST00000629983 GRK6P43250 576 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CCT8P50990 548 aa28.65■■■□□ 2.18
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF394Q53GI3 561 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
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