RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TTI1O43156 1089 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGIRP43119 386 aa25.83■■□□□ 1.73
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CAPNS1-215ENST00000628018 VEPH1Q14D04 833 aa25.83■■□□□ 1.73
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF276Q8N554 614 aa25.83■■□□□ 1.73
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CAPNS1-215ENST00000628018 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.83■■□□□ 1.73
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CAPNS1-215ENST00000628018 ARL4AP40617 200 aa25.81■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 ATL2Q8NHH9 583 aa25.8■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.79■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 TBX18O95935 607 aa25.79■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.79■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35B2Q8TB61 432 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 EPB41L5Q9HCM4 733 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 KCNU1A8MYU2 1149 aa25.78■■□□□ 1.72
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CAPNS1-215ENST00000628018 CSPG5O95196 566 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 GLUD1P00367 558 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 TGM2P21980 687 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 IRS1P35568 1242 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 PBX2P40425 430 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
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