RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619644.4

SMTN-223, Transcript of smoothelin, human

TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-223	ENST00000619644	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	BTBD7	Q9P203	1132 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TMCO1	Q9UM00	188 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ARID2	Q68CP9	1835 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	IQCF3	P0C7M6	154 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	KCNA4	P22459	653 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ACTR3	P61158	418 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	METTL7B	Q6UX53	244 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	AGR3	Q8TD06	166 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PLLP	Q9Y342	182 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	VTN	P04004	478 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ARHGAP8	P85298	464 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GBE1	Q04446	702 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	STX3	Q13277	289 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ACAD11	Q709F0	780 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	STKLD1	Q8NE28	680 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GGA3	Q9NZ52	723 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FETUB	Q9UGM5	382 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644		A0A087WZ62	844 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CILP	O75339	1184 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TM7SF2	O76062	418 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	P4HA1	P13674	534 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GMPR	P36959	345 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GRIA2	P42262	883 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SPATA24	Q86W54	205 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HIC2	Q96JB3	615 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	WWP1	Q9H0M0	922 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CHAD	O15335	359 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	B4GALT4	O60513	344 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	METTL18	O95568	372 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	APOE	P02649	317 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	INHBC	P55103	352 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PDE1B	Q01064	536 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SLC18A2	Q05940	514 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CHSY1	Q86X52	802 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	NME8	Q8N427	588 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FAM167A	Q96KS9	214 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	USP29	Q9HBJ7	922 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZBTB7A	O95365	584 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ICAM3	P32942	547 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	USP46	P62068	366 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CES3	Q6UWW8	571 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	RASSF3	Q86WH2	238 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	14.94	□□□□□ -0.02	4e-8	■■□□□ 12
SMTN-223	ENST00000619644	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CAPN14	A8MX76	684 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	KRT34	O76011	436 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	VAV1	P15498	845 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DES	P17661	470 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CHST13	Q8NET6	341 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MTBP	Q96DY7	904 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SPAG6	O75602	509 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	VDR	P11473	427 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	LCP1	P13796	627 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SLC25A3	Q00325	362 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CCDC14	Q49A88	953 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PMF1	Q6P1K2	205 aa		14.93	□□□□□ -0.02

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