RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SNX24Q9Y343 169 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 CEP83Q9Y592 693 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MYZAPP0CAP1 466 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF844Q08AG5 666 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PSMG2Q969U7 264 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MED7O43513 233 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 IVLP07476 585 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 CYP2F1P24903 491 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 FAM171BQ6P995 826 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GPR152Q8TDT2 470 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 ART4Q93070 314 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GDE1Q9NZC3 331 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 NUDT17P0C025 328 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PLTPP55058 493 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TAS2R40P59535 323 aa22.42■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MTSS1LQ765P7 747 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 C3orf20Q8ND61 904 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TFAP2BQ92481 460 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 WHRNQ9P202 907 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TECTAO75443 2155 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TSC2P49815 1807 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MICAL2O94851 1124 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GJA1P17302 382 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 CEBPBP17676 345 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 CCR2P41597 374 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 RAP1GAPP47736 663 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 DDR2Q16832 855 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PARM1Q6UWI2 310 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC31Q6UY01 552 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.42■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 DCLK3Q9C098 648 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PRU2 124 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 CETN2P41208 172 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 IRAK1P51617 712 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 EPHA5P54756 1037 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PTK6Q13882 451 aa22.41■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 CCDC142Q17RM4 750 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 ERICH1Q86X53 443 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TTC39CQ8N584 583 aa22.41■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.41■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 FGF19O95750 216 aa22.4■■□□□ 1.18
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SGMS1-210ENST00000619438 RAD23BP54727 409 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SLMAPQ14BN4 828 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 FGF14Q92915 247 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MYLPFQ96A32 169 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TNIP3Q96KP6 325 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM221A6NGB7 291 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 M0R296 226 aa22.39■■□□□ 1.18
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