RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	DPYSL3	Q14195	570 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	TRADD	Q15628	312 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	BOLA3	Q53S33	107 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	C8orf74	Q6P047	294 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	WDR93	Q6P2C0	686 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	BBS12	Q6ZW61	710 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	GPR65	Q8IYL9	337 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	VPS52	Q8N1B4	723 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	FIBCD1	Q8N539	461 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC185	Q8N715	623 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	GPR152	Q8TDT2	470 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	HSPH1	Q92598	858 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	EDEM1	Q92611	657 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	FAF2	Q96CS3	445 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	SPATA17	Q96L03	361 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	DCLK3	Q9C098	648 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ZBP1	Q9H171	429 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	LRRC19	Q9H756	370 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PIGV	Q9NUD9	493 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	OSER1	Q9NX31	292 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CLDND1	Q9NY35	253 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	RRN3	Q9NYV6	651 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	AMACR	Q9UHK6	382 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	FZD10	Q9ULW2	581 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	SCML2	Q9UQR0	700 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF292	O60281	2723 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1W2PQH9	124 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PRR23A	A6NEV1	266 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916		M0QYT0	321 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	TTI1	O43156	1089 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	TBX10	O75333	385 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ZMYND10	O75800	440 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	FGF18	O76093	207 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	MYBL2	P10244	700 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	NCAM1	P13591	858 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	TNFRSF8	P28908	595 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CHRNA3	P32297	505 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PPM1A	P35813	382 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	KCNJ1	P48048	391 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CLCN6	P51797	869 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CDH6	P55285	790 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ZXDA	P98168	799 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	DEUP1	Q05D60	604 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	GPM6B	Q13491	265 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	RAB33A	Q14088	237 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PDK2	Q15119	407 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	DPYSL2	Q16555	572 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CCNG2	Q16589	344 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	KAZN	Q674X7	775 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	TPGS2	Q68CL5	300 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	TAC4	Q86UU9	113 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	FAM131B	Q86XD5	332 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	VSIG1	Q86XK7	387 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	PQLC3	Q8N755	202 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	KCTD6	Q8NC69	237 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ADAM32	Q8TC27	787 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	SEC14L1	Q92503	715 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PVT1-222	ENST00000613916	RUBCN	Q92622	972 aa		7.62	□□□□□ -1.19

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