RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609571.5

ATRNL1-209, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-209ENST00000609571 APBB2Q92870 758 aa28.43■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 TMEM209Q96SK2 561 aa28.43■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 MAGEB5Q9BZ81 275 aa28.43■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 KLC2Q9H0B6 622 aa28.43■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 DTLQ9NZJ0 730 aa28.43■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 TRIM17Q9Y577 477 aa28.43■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 C5orf60A6NFR6 353 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 ENPP3O14638 875 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 SYN3O14994 580 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 NBNO60934 754 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 PHBP35232 272 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 RABGGTBP53611 331 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 RASA2Q15283 850 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP11CQ8NB49 1132 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 FETUBQ9UGM5 382 aa28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 GOLGA8MH3BSY2 632 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 OR1G1P47890 313 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 FNBP1LQ5T0N5 605 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 KCNT2Q6UVM3 1135 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 PYROXD1Q8WU10 500 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 SEPT8Q92599 483 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 RAB6BQ9NRW1 208 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 EURLQ9NYK6 297 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 RAD54BQ9Y620 910 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 F8W810 466 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 CXCR3P49682 368 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 SEMA3BQ13214 749 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 DPYSQ14117 519 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 BSPRYQ5W0U4 402 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 DDIT4Q9NX09 232 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 NR1H3Q13133 447 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 RFX8Q6ZV50 586 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 EXOC3L1Q86VI1 746 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 ABI1Q8IZP0 508 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 BCAS4Q8TDM0 211 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 COLEC11Q9BWP8 271 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 VPS37BQ9H9H4 285 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 TMEM51Q9NW97 253 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 COX16Q9P0S2 106 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 ACTL7BQ9Y614 415 aa28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 GPNMBQ14956 572 aa28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 CCDC13Q8IYE1 715 aa28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 FERMT1Q9BQL6 677 aa28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 ETNK2Q9NVF9 386 aa28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1-209ENST00000609571 NRLP54845 237 aa28.39■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 GAD2Q05329 585 aa28.39■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 SLC24A2Q9UI40 661 aa28.39■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 HOXA2O43364 376 aa28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 TADA2AO75478 443 aa28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 PDK1Q15118 436 aa28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 MSS51Q4VC12 460 aa28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 CCDC38Q502W7 563 aa28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 MCUQ8NE86 351 aa28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 SELENOSQ9BQE4 189 aa28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 TNFRSF10BO14763 440 aa28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 DCLK1O15075 740 aa28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 VPS52Q8N1B4 723 aa28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 WDCPQ9H6R7 721 aa28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 CLUHO75153 1309 aa28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 CREB3O43889 395 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 MFSD11O43934 449 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 SPAG6O75602 509 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 MAP3K6O95382 1288 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 TPSB2P20231 275 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 CYP2C18P33260 490 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 GRIK1P39086 918 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 GPX6P59796 221 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 TPSAB1Q15661 275 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 VSTM1Q6UX27 236 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 FBXO36Q8NEA4 188 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 ADAM32Q8TC27 787 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 HTR3CQ8WXA8 447 aa28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1-209ENST00000609571 EDEM1Q92611 657 aa28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms