RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	AGPS	O00116	658 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TTC4	O95801	387 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ERCC2	P18074	760 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	LRPAP1	P30533	357 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ACBD6	Q9BR61	282 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SCN4A	P35499	1836 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61	4e-7	■■■■■ 68.1
ILF3-222	ENST00000592763	CACNA2D1	P54289	1103 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PDK1	Q15118	436 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	IQCK	Q8N0W5	287 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CABS1	Q96KC9	395 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	RLF	Q13129	1914 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ENPP3	O14638	875 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	F9	P00740	461 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MT-ND3	P03897	115 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	YWHAQ	P27348	245 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ALDH1A3	P47895	512 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DAOA	P59103	153 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763		A0A1W2PQH9	124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	HOXA2	O43364	376 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	LPXN	O60711	386 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PMPCB	O75439	489 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ENDOD1	O94919	500 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	EOMES	O95936	686 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CCR1	P32246	355 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SERPINB6	P35237	376 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TUB	P50607	506 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GAD2	Q05329	585 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	FUT10	Q6P4F1	479 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF623	O75123	536 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ADRA1B	P35368	520 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ELK3	P41970	407 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	IPMK	Q8NFU5	416 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ART4	Q93070	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NDC80	O14777	642 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GNRH1	P01148	92 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TPH1	P17752	444 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	UROC1	Q96N76	676 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	RNF103	O00237	685 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TAF10	Q12962	218 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	LGSN	Q5TDP6	509 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	FBF1	Q8TES7	1133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SP110	Q9HB58	689 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CHN1	P15882	459 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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