RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592535.5

APOC1-208, Transcript of apolipoprotein C1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOC1, Length 430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1-208ENST00000592535 ARHGAP8P85298 464 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MAN2A1Q16706 1144 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 HMGB4Q8WW32 186 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SIX2Q9NPC8 291 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ST7Q9NRC1 585 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DACH1Q9UI36 760 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MED7O43513 233 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 RHOBTB1O94844 696 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CYBBP04839 570 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FYNP06241 537 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 USP8P40818 1118 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ELF2Q15723 593 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GEN1Q17RS7 908 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CHPFQ8IZ52 775 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DDI1Q8WTU0 396 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 RLN3Q8WXF3 142 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SHC3Q92529 594 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GOLGA1Q92805 767 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FAM81BQ96LP2 452 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 A0A1W2PQF6 199 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TSPAN3O60637 253 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 IGLV3-27P01718 113 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MPLP40238 635 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 P2RY2P41231 377 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ACADSBP45954 432 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MEA1Q16626 185 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 VWA3BQ502W6 1294 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MPPE1Q53F39 396 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MIIPQ5JXC2 388 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PMS2CLQ68D20 193 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SDE2Q6IQ49 451 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PGBD3Q8N328 593 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FRMD1Q8N878 549 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GPT2Q8TD30 523 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 STK32AQ8WU08 396 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 NDST4Q9H3R1 872 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 RAD54BQ9Y620 910 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 WASH3PC4AMC7 463 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 E5RJQ4 531 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GFRA2O00451 464 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GDF9O60383 454 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LATS1O95835 1130 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ZNF806P0C7X5 589 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 NCAM1P13591 858 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GABRG2P18507 467 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TBX4P57082 545 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CREB5Q02930 508 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ADGRF1Q5T601 910 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 C11orf74Q86VG3 221 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GBP4Q96PP9 640 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GABRG3Q99928 467 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CD248Q9HCU0 757 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CKAP5Q14008 2032 aa14.46□□□□□ -0.1
APOC1-208ENST00000592535 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.45□□□□□ -0.1
APOC1-208ENST00000592535 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
APOC1-208ENST00000592535 KCNJ18B7U540 433 aa14.45□□□□□ -0.1
APOC1-208ENST00000592535 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
APOC1-208ENST00000592535 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms