RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592358.1

UBXN6-208, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-208ENST00000592358 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ADAM15Q13444 863 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 BRD3Q15059 726 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 LLGL1Q15334 1064 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DUSP6Q16828 381 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 WDR93Q6P2C0 686 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 BNIPLQ7Z465 357 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 MON1AQ86VX9 555 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 RNF139Q8WU17 664 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 EDEM1Q92611 657 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FBXO32Q969P5 355 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CALN1Q9BXU9 219 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ZBP1Q9H171 429 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 LRRC19Q9H756 370 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 IL37Q9NZH6 218 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 COX16Q9P0S2 106 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 STIM2Q9P246 746 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FNIP2Q9P278 1114 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 RAB21Q9UL25 225 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 MAFFQ9ULX9 164 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 NR2E1Q9Y466 385 aa16.37■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FAM187AA6NFU0 413 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 PRR33A8MZF0 331 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF487B1APH4 448 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ABLIM3O94929 683 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 KRT10P13645 584 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 PSEN1P49768 467 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DR1Q01658 176 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 RAB33AQ14088 237 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 TFDP2Q14188 446 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CCNG2Q16589 344 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 TAZQ16635 292 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ARL13BQ3SXY8 428 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FAM131BQ86XD5 332 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 IFT20Q8IY31 132 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 TTC13Q8NBP0 860 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 PNKPQ96T60 521 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DCLK3Q9C098 648 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DDIT4Q9NX09 232 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 AMACRQ9UHK6 382 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FZD10Q9ULW2 581 aa16.36■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 MYO7AQ13402 2215 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 A0A1W2PQH9 124 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 SOAT2O75908 522 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CXCL14O95715 111 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 GLP2RO95838 553 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CTSAP10619 480 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ATF2P15336 505 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ELF1P32519 619 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 LTBRP36941 435 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ARSEP51690 589 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 SLC7A5Q01650 507 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DPYSL3Q14195 570 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DPYSL2Q16555 572 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 EFHC2Q5JST6 749 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 BBS12Q6ZW61 710 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC185Q8N715 623 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FAM71BQ8TC56 605 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 NTAN1Q96AB6 310 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF670Q9BS34 389 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 RAB17Q9H0T7 212 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
UBXN6-208ENST00000592358 FAM50BQ9Y247 325 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms