RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH10P35580 1976 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPNS1P04632 268 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR29P0C7W0 189 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 COG7P83436 770 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NFIL3Q16649 462 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS6Q8IU80 811 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND1CQ8IV53 801 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GTW7 788 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NPC1O15118 1278 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL1P05976 194 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 FTH1P19P0C7X4 201 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCHP24723 683 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TPMTP51580 245 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF132P52740 706 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF234Q14588 700 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CACUL1Q86Y37 369 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPLA1Q8N8W4 532 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CADM4Q8NFZ8 388 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 SORCS1Q8WY21 1168 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 DCLK3Q9C098 648 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 IL21RQ9HBE5 538 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 USP25Q9UHP3 1055 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 LHX6Q9UPM6 363 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 HPSEQ9Y251 543 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT13P13646 458 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CMA1P23946 247 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 COPAP53621 1224 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF12L1Q5VU92 463 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 UCMAQ8WVF2 138 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA4DQ92854 862 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SIPA1Q96FS4 1042 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM8AQ9HCN3 771 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOVL2Q9NXB9 296 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH2Q9P0N8 246 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOBTB3O94955 611 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB41Q5JT25 222 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM215Q68D42 235 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGZQ86VD9 579 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PROSER1Q86XN7 944 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CPXM2Q8N436 756 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A11Q8NBS3 891 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PKD1L2Q7Z442 2459 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1GO43497 2377 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A8A0AV02 714 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL12A8MUP2 240 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CBFA2T3O75081 653 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-19P01714 112 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CYBBP04839 570 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 BNC1Q01954 994 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ENPEPQ07075 957 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM217AQ8IXS0 508 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID3AQ99856 593 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CIPCQ9C0C6 399 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CISHQ9NSE2 258 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 OXTRP30559 389 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD23BP54727 409 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAPQ12770 1279 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT39Q6A163 491 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP18Q8N392 663 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DDI1Q8WTU0 396 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM176AQ96HP8 235 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHX1P07099 455 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DPYDQ12882 1025 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM9Q13443 819 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 HSCBQ8IWL3 235 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 GAREM1Q9H706 876 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ACADMP11310 421 aa26.83■■□□□ 1.89
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