RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589934.1

APBA3-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-204	ENST00000589934	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	KRT35	Q92764	455 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FGF13	Q92913	245 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GFRA2	O00451	464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	KIF5C	O60282	957 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	STC2	O76061	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ADRA1B	P35368	520 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MARCKSL1	P49006	195 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	NME3	Q13232	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934		Q6ZNB5	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ALG3	Q92685	438 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MYADM	Q96S97	322 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ESPN	B1AK53	854 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RNF8	O76064	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RARA	P10276	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FCAR	P24071	287 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	IL4R	P24394	825 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GBP1	P32455	592 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MTHFR	P42898	656 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TBX4	P57082	545 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	COG7	P83436	770 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TAZ	Q16635	292 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CA9	Q16790	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MBTPS2	O43462	519 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	KCNA5	P22460	613 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CCR1	P32246	355 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	AIF1	P55008	147 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GNG11	P61952	73 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	AMPD2	Q01433	879 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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