RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPATA20Q8TB22 786 aa29.55■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC35C1Q96A29 364 aa29.55■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADIGQ0VDE8 80 aa29.54■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BECN1Q14457 450 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STARD3Q14849 445 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DUOXA1Q1HG43 343 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CEP76Q8TAP6 659 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBA3Q8TBC4 463 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLD4Q96BZ4 506 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRGPRX1Q96LB2 322 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD93Q9NPY3 652 aa29.54■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BHLHA9Q7RTU4 235 aa29.53■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DDI1Q8WTU0 396 aa29.53■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RNF139Q8WU17 664 aa29.53■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UCMAQ8WVF2 138 aa29.53■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FSCN3Q9NQT6 498 aa29.53■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FMNL3Q8IVF7 1028 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TIGD1Q96MW7 591 aa29.52■■■□□ 2.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 O00370 1275 aa29.51■■■□□ 2.31
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FMO5P49326 533 aa29.51■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FUT11Q495W5 492 aa29.51■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RABEPKQ7Z6M1 372 aa29.51■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa29.51■■■□□ 2.31
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LCP1P13796 627 aa29.49■■■□□ 2.31
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC32A1Q9H598 525 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAPN10Q9HC96 672 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNGB3Q9NQW8 809 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCC13Q9NSE7 274 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FRYQ5TBA9 3013 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAEPP09466 180 aa29.47■■■□□ 2.31
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD6P30203 668 aa29.47■■■□□ 2.31
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