RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570150.1

PKD1-238, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-238	ENST00000570150	DENND1C	Q8IV53	801 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PHOX2B	Q99453	314 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150		A0A1W2PQJ5	194 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ANKRD62	A6NC57	917 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MDM4	O15151	490 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	IGLV3-27	P01718	113 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CALB1	P05937	261 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	HMBS	P08397	361 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TPM1	P09493	284 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TYR	P14679	529 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ABCB4	P21439	1286 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CCR1	P32246	355 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NOS2	P35228	1153 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MTAP	Q13126	283 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	DCAF6	Q58WW2	860 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	18.73	■□□□□ 0.59	3e-7	■■■■□ 26.2
PKD1-238	ENST00000570150	PIEZO1	Q92508	2521 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	COL4A2	P08572	1712 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PIK3R2	O00459	728 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TIMM44	O43615	452 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	DAB1	O75553	588 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	KAT7	O95251	611 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CALCA	P01258	141 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CNR2	P34972	360 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MATK	P42679	507 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	KLK7	P49862	253 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TRIM14	Q14142	442 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TAF3	Q5VWG9	929 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SDE2	Q6IQ49	451 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TMEM25	Q86YD3	366 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	UCMA	Q8WVF2	138 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	F5	P12259	2224 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150		H0Y858	1186 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TULP3	O75386	442 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	GABBR2	O75899	941 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MME	P08473	750 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MMP8	P22894	467 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	OPRD1	P41143	372 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	DGKG	P49619	791 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	OXCT1	P55809	520 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NOMO3	P69849	1222 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SYT13	Q7L8C5	426 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	DDI1	Q8WTU0	396 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	RNF34	Q969K3	372 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	AGPAT1	Q99943	283 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	EPHB6	O15197	1021 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-238	ENST00000570150	TEX33	O43247	280 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-238	ENST00000570150	ACSL4	O60488	711 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-238	ENST00000570150	KLKB1	P03952	638 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-238	ENST00000570150	ERBB2	P04626	1255 aa		18.7	■□□□□ 0.58

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