RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPAN3	O60637	253 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO21	O94952	628 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	LTF	P02788	710 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC9A1	P19634	815 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	BCKDHB	P21953	392 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GPD2	P43304	727 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	E2F5	Q15329	346 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PMS2CL	Q68D20	193 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GBP6	Q6ZN66	633 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	UCMA	Q8WVF2	138 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RY11	Q96G91	374 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MED15	Q96RN5	788 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GABRG3	Q99928	467 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ST7	Q9NRC1	585 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PQF6	199 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	WASH3P	C4AMC7	463 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	NPC1	O15118	1278 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	THAP12	O43422	761 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF217	O75362	1048 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	LATS1	O95835	1130 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	NCAM1	P13591	858 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GABRG2	P18507	467 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	USP8	P40818	1118 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ACADSB	P45954	432 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	LIMK1	P53667	647 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF445	P59923	1031 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GEN1	Q17RS7	908 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ADGRF1	Q5T601	910 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	IL31	Q6EBC2	164 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GJB7	Q6PEY0	223 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FRMD1	Q8N878	549 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	STK32A	Q8WU08	396 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	THAP9	Q9H5L6	903 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DACH1	Q9UI36	760 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		9.8	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH10	P35580	1976 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CAPN9	O14815	690 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PON1	P27169	355 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GNA15	P30679	374 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC11A2	P49281	568 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TBX4	P57082	545 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ARID5A	Q03989	594 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	RING1	Q06587	406 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	STARD3	Q14849	445 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MEA1	Q16626	185 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	STPG1	Q5TH74	334 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PIGK	Q92643	395 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	AZIN2	Q96A70	460 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		9.79	□□□□□ -0.84

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