RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 PNPLA1Q8N8W4 532 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 IL21RQ9HBE5 538 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ITM2CQ9NQX7 267 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SLC12A8A0AV02 714 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TAF4O00268 1085 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SYPP08247 313 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 NCAM1P13591 858 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 PRKCHP24723 683 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SYKP43405 635 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TPMTP51580 245 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 COPAP53621 1224 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 COG7P83436 770 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 BNC1Q01954 994 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 GRIK2Q13002 908 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 RAB41Q5JT25 222 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SPATA32Q96LK8 384 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 CISHQ9NSE2 258 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 USP25Q9UHP3 1055 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 NUMA1Q14980 2115 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 MEI4A8MW99 385 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TSPAN3O60637 253 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 CAPNS1P04632 268 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 MYL1P05976 194 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 HLA-EP13747 358 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 CHKAP35790 457 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TKTL1P51854 596 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 STARD3Q14849 445 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 KRT39Q6A163 491 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FAM124AQ86V42 546 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 NAXDQ8IW45 347 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ZNF366Q8N895 744 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FOXJ1Q92949 421 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 DCLK3Q9C098 648 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 CIPCQ9C0C6 399 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 CACNA1GO43497 2377 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TMEM131Q92545 1883 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 PTPRBP23467 1997 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 EPHX1P07099 455 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 RING1Q06587 406 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 DDI1Q8WTU0 396 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 RAB20Q9NX57 234 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 A0A1B0GTW7 788 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 METTL12A8MUP2 240 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 ZBED1O96006 694 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 GNSP15586 552 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 MXI1P50539 228 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SGSHP51688 502 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 PDE4CQ08493 712 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-203ENST00000562011 SLC14A1Q13336 389 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms