RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCUQ8NE86 351 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK32AQ8WU08 396 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TLE6Q9H808 572 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR27A2RRH5 827 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPN9P43378 593 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 BEST2Q8NFU1 509 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NSL1Q96IY1 281 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM159BA6NKW6 160 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 FCHO1O14526 889 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLXNB2O15031 1838 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF410Q86VK4 478 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF39Q9H2S5 420 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.65■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPR32O75388 356 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DESP17661 470 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CBLBQ13191 982 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNAPC2Q13487 334 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASC4Q6P4E1 433 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 E2F7Q96AV8 911 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GSC2O15499 205 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC22O60826 627 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT38O76015 456 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCNFP41002 786 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP3Q9Y6I4 520 aa20.64■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GYG2O15488 501 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MFSD11O43934 449 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC6O75061 913 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPSB2P20231 275 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 RABGGTBP53611 331 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCAT1P54687 386 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPSAB1Q15661 275 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 LGSNQ5TDP6 509 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 C16orf46Q6P387 395 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 UNC93AQ86WB7 457 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEFB106AQ8N104 65 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBXO27Q8NI29 283 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC39Q96DD0 335 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 I3L4J1 428 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDHXO00330 501 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLF11O14901 512 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 HIC1Q14526 733 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEX44Q53QW1 395 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.63■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KPNA7A9QM74 516 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLDN5O00501 218 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GMPRP36959 345 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 OLIG2Q13516 323 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEMA5AQ13591 1074 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DPP9Q86TI2 863 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TREML1Q86YW5 311 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms