RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	SCNN1G	P51170	649 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	JAM2	P57087	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SPAG1	Q07617	926 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CLUL1	Q15846	466 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	RESP18	Q5W5W9	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAL	Q6DHV7	355 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DAW1	Q8N136	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC43	Q8N309	656 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC15	Q8TF66	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ACCS	Q96QU6	501 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CWH43	Q9H720	699 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TLE6	Q9H808	572 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DTL	Q9NZJ0	730 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	KCND2	Q9NZV8	630 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TBX20	Q9UMR3	447 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNK3	O14649	394 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NRP1	O14786	923 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	RECQL4	O94761	1208 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF202	O95125	648 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	AMY2A	P04746	511 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	EDN1	P05305	212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PFKFB1	P16118	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	AMY2B	P19961	511 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CMA1	P23946	247 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJB1	P25685	340 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	FLT3	P36888	993 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NRIP1	P48552	1158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC11A1	P49279	550 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ACOT2	P49753	483 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFA8	P51970	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPK7	Q13164	816 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CUL4B	Q13620	913 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF460	Q14592	562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CR1L	Q2VPA4	569 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SDE2	Q6IQ49	451 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	STK32C	Q86UX6	486 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS52	Q8N1B4	723 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	HASPIN	Q8TF76	798 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC51	Q96ER9	411 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PAGE5	Q96GU1	130 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6

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