RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555916.1

AC005480.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC005480.1, Length 3,548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005480.1-202ENST00000555916 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ATP6V1C1P21283 382 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 IVDP26440 423 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 NRLP54845 237 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CLUL1Q15846 466 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CFAP157Q5JU67 520 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 NT5C1BQ96P26 610 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 MIPEPQ99797 713 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 STOML1Q9UBI4 398 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 LRRC42Q9Y546 428 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 UBE4BO95155 1302 aa6.51□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 B2RBV5 119 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TXNDC9O14530 226 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 USP1O94782 785 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 LIG4P49917 911 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CACNA2D1P54289 1103 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 STAT4Q14765 748 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TRABD2AQ86V40 505 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CD101Q93033 1021 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM143Q96AN5 459 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM136AQ96C01 138 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 NLRP4Q96MN2 994 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 OBP2AQ9NY56 170 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 MYH11P35749 1972 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 H3BRJ5 948 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 FSCN2O14926 492 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 STBD1O95210 358 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 C22orf31O95567 290 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 KRT1P04264 644 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TNNI1P19237 187 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CLCN3P51790 818 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ARFIP2P53365 341 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 DAW1Q8N136 415 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 FIZ1Q96SL8 496 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 GINS2Q9Y248 185 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 K7ERI5 159 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 AHCYL1O43865 530 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 TBX10O75333 385 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 PTK6Q13882 451 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 RNF149Q8NC42 400 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 A0A1W2PRU2 124 aa6.49□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 CCDC160A6NGH7 325 aa6.49□□□□□ -1.37
AC005480.1-202ENST00000555916 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms