RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	PTK2	Q05397	1052 aa		21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	TAF5	Q15542	800 aa		21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	CPXM2	Q8N436	756 aa		21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		21.78	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	APBB3	O95704	486 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	CHKA	P35790	457 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	RUBCN	Q92622	972 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	LHX5	Q9H2C1	402 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		21.77	■■□□□ 1.08
CS-222	ENST00000550996		F8VZ95	297 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	NCAM1	P13591	858 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DGKG	P49619	791 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CRY1	Q16526	586 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TAC4	Q86UU9	113 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ADAM32	Q8TC27	787 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	EBF1	Q9UH73	591 aa		21.76	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	AXIN1	O15169	862 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TSPAN3	O60637	253 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ERBB2	P04626	1255 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ATP1A3	P13637	1013 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CYP11B1	P15538	503 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CNR2	P34972	360 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SGSH	P51688	502 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	BEND5	Q7L4P6	421 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	GAB3	Q8WWW8	586 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	GOLGA1	Q92805	767 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ACOX2	Q99424	681 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	STK33	Q9BYT3	514 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		21.75	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	LGALS16	A8MUM7	142 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	KRT9	P35527	623 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TBX4	P57082	545 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	GEN1	Q17RS7	908 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ADGRF1	Q5T601	910 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	RASSF3	Q86WH2	238 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SLC39A13	Q96H72	371 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		21.74	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FAM170A	A1A519	330 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DCLK1	O15075	740 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	LATS1	O95835	1130 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	IGLV3-25	P01717	112 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TGM1	P22735	817 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SLC6A4	P31645	630 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	WAS	P42768	502 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	RING1	Q06587	406 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SYCP1	Q15431	976 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TAF3	Q5VWG9	929 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ANO7	Q6IWH7	933 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	HINFP	Q9BQA5	517 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CD248	Q9HCU0	757 aa		21.73	■■□□□ 1.07

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