RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 RAD54BQ9Y620 910 aa15.1■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 BECN2A8MW95 431 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 KCNJ18B7U540 433 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 CAPN9O14815 690 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 EPN2O95208 641 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 BCKDHBP21953 392 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 ACADSBP45954 432 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 TBX4P57082 545 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP8P85298 464 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 KCNJ12Q14500 433 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 CSRP2Q16527 193 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 SCML4Q8N228 414 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 ADAM32Q8TC27 787 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 NDST4Q9H3R1 872 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF292O60281 2723 aa15.09■□□□□ 0.01
HECTD4-212ENST00000550724 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 E5RJQ4 531 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 LRP3O75074 770 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 GEN1Q17RS7 908 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 MPPE1Q53F39 396 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 CPXM2Q8N436 756 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 GPT2Q8TD30 523 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 LOXL4Q96JB6 756 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SPACA7Q96KW9 195 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 CIPCQ9C0C6 399 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SIX2Q9NPC8 291 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 FAM170AA1A519 330 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 WASH3PC4AMC7 463 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 GDF9O60383 454 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 MPLP40238 635 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SLC11A2P49281 568 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 ARID5AQ03989 594 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 PTK2Q05397 1052 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 ADGRF1Q5T601 910 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 C11orf74Q86VG3 221 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 DEFB119Q8N690 84 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 FRMD1Q8N878 549 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 UCMAQ8WVF2 138 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SHC3Q92529 594 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 STIM2Q9P246 746 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 FBXO10Q9UK96 956 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 FRYLO94915 3013 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 A0A1W2PQF6 199 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 TBL1XO60907 577 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 GABRG2P18507 467 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SDHBP21912 280 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 KCNA4P22459 653 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 KRT9P35527 623 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 PDCLQ13371 301 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 MIIPQ5JXC2 388 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
HECTD4-212ENST00000550724 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms