RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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TRDN-205ENST00000546248 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TRDN-205ENST00000546248 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP25P42331 645 aa5.9□□□□□ -1.46
TRDN-205ENST00000546248 ZNF131P52739 623 aa5.9□□□□□ -1.46
TRDN-205ENST00000546248 OAZ1P54368 228 aa5.9□□□□□ -1.46
TRDN-205ENST00000546248 MAPK7Q13164 816 aa5.9□□□□□ -1.46
TRDN-205ENST00000546248 MEA1Q16626 185 aa5.9□□□□□ -1.46
TRDN-205ENST00000546248 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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TRDN-205ENST00000546248 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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TRDN-205ENST00000546248 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.9□□□□□ -1.46
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TRDN-205ENST00000546248 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa5.89□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 GABRDO14764 452 aa5.89□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CETN3O15182 167 aa5.89□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 CCNE2O96020 404 aa5.89□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 TPM1P09493 284 aa5.89□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa5.89□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 MYH6P13533 1939 aa5.89□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 CLIC2O15247 247 aa5.88□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CALUO43852 315 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
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