RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 IL12RB1P42701 662 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 UBXN2AP68543 259 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 GPC5P78333 572 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 FAM153CQ494X1 144 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 STX12Q86Y82 276 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 MROH8Q9H579 483 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 AKAP10O43572 662 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 MGRN1O60291 552 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 TRIM49CP0CI26 452 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 NPTX2P47972 431 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 LIG4P49917 911 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 HMGCS2P54868 508 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 PSMG1O95456 288 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 ACTR2P61160 394 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PPIL2Q13356 520 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 SVOPQ8N4V2 548 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 IL31RAQ8NI17 732 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 TAC1P20366 129 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 RXRGP48443 463 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 STX5Q13190 355 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 EMC2Q15006 297 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 BBS9Q3SYG4 887 aa6.23□□□□□ -1.41
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