RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 CDK17Q00537 523 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPRK-222ENST00000532751 Q6ZS52 159 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPRK-222ENST00000532751 IGLV3-25P01717 112 aa22.82■■□□□ 1.24
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PTPRK-222ENST00000532751 TNFAIP3P21580 790 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 MMP8P22894 467 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 MATKP42679 507 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 TNFRSF4P43489 277 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 SEC13P55735 322 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 SATB1Q01826 763 aa22.82■■□□□ 1.24
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