RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 SCML2Q9UQR0 700 aa24.08■■□□□ 1.45
ACER3-204ENST00000525861 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 I6L893 689 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 NUDT17P0C025 328 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 GBE1Q04446 702 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 XRCC4Q13426 336 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CEP85LQ5SZL2 805 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 DENND2CQ68D51 928 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PCGF5Q86SE9 256 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 SCD5Q86SK9 330 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 WDCPQ9H6R7 721 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 KIAA0355O15063 1070 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CSF2RAP15509 400 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 ZNF844Q08AG5 666 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 SEMA3BQ13214 749 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RTP4Q96DX8 246 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 IGSF21Q96ID5 467 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 USP29Q9HBJ7 922 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.07■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PLXNA3P51805 1871 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CREB3O43889 395 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 AMHP03971 560 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 USP41Q3LFD5 358 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CEP128Q6ZU80 1094 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 ARL8AQ96BM9 186 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 IL37Q9NZH6 218 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RIPK2O43353 540 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 MAP3K6O95382 1288 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 DPYSQ14117 519 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RFX8Q6ZV50 586 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 MON1AQ86VX9 555 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 NMUR1Q9HB89 426 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 DTLQ9NZJ0 730 aa24.06■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 IRAK2O43187 625 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 EFCAB14O75071 495 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 VNN2O95498 520 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RAG1P15918 1043 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PGFP49763 221 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 SLC29A2Q14542 456 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 TTMPQ5BVD1 217 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RELL1Q8IUW5 271 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 STKLD1Q8NE28 680 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PWWP2AQ96N64 755 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 MTRRQ9UBK8 725 aa24.05■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 A0A1W2PQH9 124 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 FAM72CH0Y354 149 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 KCNN4O15554 427 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CAPN2P17655 700 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 RBL1P28749 1068 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 HCAR3P49019 387 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 DEFB103AP81534 67 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 MFSD5Q6N075 450 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 FAM72BQ86X60 149 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 OLFM3Q96PB7 478 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 FAM92AA1XBS5 289 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 NRLP54845 237 aa24.04■■□□□ 1.44
ACER3-204ENST00000525861 USP46P62068 366 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms