RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-210	ENST00000522344	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RRH	O14718	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MMP8	P22894	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CPA2	P48052	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TBX4	P57082	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MTA1	Q13330	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GAB1	Q13480	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MYD88	Q99836	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344		J3KTA2	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PLAU	P00749	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CD63	P08962	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	DUSP1	P28562	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TM4SF4	P48230	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SRL	Q86TD4	932 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SOCS2	O14508	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CTSA	P10619	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MATN1	P21941	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	NDUFS1	P28331	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	NR4A2	P43354	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HSF1	Q00613	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CFHR1	Q03591	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	NRAC	Q8N912	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PMM1	Q92871	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	GDF15	Q99988	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PRY	O14603	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TLR2	O60603	784 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PRF1	P14222	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ABCB4	P21439	1286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC8A1	P32418	973 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	IDUA	P35475	653 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HSPA7	P48741	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	AGTR2	P50052	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CSHL1	Q14406	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RAB30	Q15771	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MUL1	Q969V5	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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