RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 SKAP1Q86WV1 359 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 APOL5Q9BWW9 433 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.84□□□□□ -1.63
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UBE2B-202ENST00000499038 DECR2Q9NUI1 292 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.84□□□□□ -1.63
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UBE2B-202ENST00000499038 LRRC46Q96FV0 321 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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UBE2B-202ENST00000499038 TMOD4Q9NZQ9 345 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 IL18RAPO95256 599 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 TFEBP19484 476 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 CDC25AP30304 524 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
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UBE2B-202ENST00000499038 KCNJ12Q14500 433 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4.82□□□□□ -1.64
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UBE2B-202ENST00000499038 MATN1P21941 496 aa4.81□□□□□ -1.64
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UBE2B-202ENST00000499038 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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UBE2B-202ENST00000499038 LRP12Q9Y561 859 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 PRYO14603 147 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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UBE2B-202ENST00000499038 ARP10275 920 aa4.8□□□□□ -1.64
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UBE2B-202ENST00000499038 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 P2RY11Q96G91 374 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 WDR24Q96S15 920 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM2Q9C040 744 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-202ENST00000499038 A0A087WZ62 844 aa4.79□□□□□ -1.64
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