RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CD59	P13987	128 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GNS	P15586	552 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP3CC	P48454	512 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A9	P82251	487 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZXDB	P98169	803 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GAD2	Q05329	585 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	HYAL2	Q12891	473 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO4	Q32M45	955 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PKMYT1	Q99640	499 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DEC1	Q9P2X7	70 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH11	P35749	1972 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQD8	194 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BQV1	296 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A4	O43511	780 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ICMT	O60725	284 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRG2	P18507	467 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	EHHADH	Q08426	723 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DYM	Q7RTS9	669 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD54L	Q92698	747 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	HVCN1	Q96D96	273 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MMS19	Q96T76	1030 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	NACA2	Q9H009	215 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN1A	P35498	2009 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MEI4	A8MW99	385 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511		F8VP50	259 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRD	O14764	452 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNC2	P02585	160 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	LMO2	P25791	158 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ADSS	P30520	456 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	NTSR1	P30989	418 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DDIT3	P35638	169 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	RAC1	P63000	192 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF10	Q12962	218 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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