RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	GABRB2	P47870	512 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SEC13	P55735	322 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CDK17	Q00537	523 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MESP2	Q0VG99	397 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NME3	Q13232	169 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	LRRC32	Q14392	662 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024		Q6ZS52	159 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PRSS33	Q8NF86	280 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	RNF34	Q969K3	372 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	EXOC4	Q96A65	974 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CLDN23	Q96B33	292 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SERPINB11	Q96P15	392 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	RBSN	Q9H1K0	784 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ANTXRL	A6NF34	631 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024		H0Y858	1186 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	IRAK2	O43187	625 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	LAMTOR5	O43504	91 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	RNF40	O75150	1001 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TULP3	O75386	442 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV3-27	P01718	113 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GYPC	P04921	128 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DRD1	P21728	446 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MMP8	P22894	467 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CASP14	P31944	242 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GBP1	P32455	592 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NOS2	P35228	1153 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SULT1E1	P49888	294 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MTAP	Q13126	283 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CCIN	Q13939	588 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GAS6	Q14393	721 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ANGPT1	Q15389	498 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FIGN	Q5HY92	759 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	BEND5	Q7L4P6	421 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	EMC1	Q8N766	993 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DDI1	Q8WTU0	396 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	P2RY11	Q96G91	374 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PNKP	Q96T60	521 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM5	Q9C035	493 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77	5e-7	■■■■□ 21.5
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1W2PQJ5	194 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024		M0QYT0	321 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	AP5Z1	O43299	807 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ACSL4	O60488	711 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	KAT7	O95251	611 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	APOE	P02649	317 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CYBB	P04839	570 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	APOD	P05090	189 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FLT3	P36888	993 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MATK	P42679	507 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MAGEA9	P43362	315 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SLC11A2	P49281	568 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ZBED6	P86452	979 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CENPC	Q03188	943 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	RING1	Q06587	406 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PTP4A2	Q12974	167 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NNT	Q13423	1086 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	C2orf27A	Q580R0	203 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ADGRF1	Q5T601	910 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		10.21	□□□□□ -0.77

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