RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495491.5

HCLS1-211, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,219 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-211	ENST00000495491	TSG101	Q99816	390 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ARID3A	Q99856	593 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	KNL1	Q8NG31	2342 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491		O00370	1275 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	P4HA2	O15460	535 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PAEP	P09466	180 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	VDR	P11473	427 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ITPKA	P23677	461 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PNOC	Q13519	176 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	FOXJ1	Q92949	421 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	CYBB	P04839	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ENG	P17813	658 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	TKTL1	P51854	596 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	NUCB2	P80303	420 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	STARD3	Q14849	445 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	STIL	Q15468	1287 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	MEA1	Q16626	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PGBD3	Q8N328	593 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	UCMA	Q8WVF2	138 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	MYH10	P35580	1976 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PSMA7	O14818	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	GJB3	O75712	270 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	PROS1	P07225	676 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	OXTR	P30559	389 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	FMO5	P49326	533 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	RING1	Q06587	406 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	CNGA2	Q16280	664 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	GEN1	Q17RS7	908 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	FUT11	Q495W5	492 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	LMO3	Q8TAP4	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-211	ENST00000495491	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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