RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	USP8	P40818	1118 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	PTK2	Q05397	1052 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	RING1	Q06587	406 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	CEP68	Q76N32	757 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	MIS12	Q9H081	205 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	LAMA1	P25391	3075 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	ADAM23	O75077	832 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	FYN	P06241	537 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	NCAM1	P13591	858 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	LPAL2	Q16609	132 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	BHMT	Q93088	406 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	HCN2	Q9UL51	889 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM28-208	ENST00000495327	PRRT4	C9JH25	899 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	UCHL3	P15374	230 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	TGM1	P22735	817 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	NTSR1	P30989	418 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	CLCN1	P35523	988 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	TBX4	P57082	545 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	BPIFB4	P59827	614 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	MYL5	Q02045	173 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	KRT31	Q15323	416 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	GABRG3	Q99928	467 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	NPC1	O15118	1278 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	IRAK2	O43187	625 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	EPN2	O95208	641 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	TPM2	P07951	284 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	GLI1	P08151	1106 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	HOXB2	P14652	356 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	E2F5	Q15329	346 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM28-208	ENST00000495327	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.88	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms