RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RNF34Q969K3 372 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 LOXL4Q96JB6 756 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SGK1O00141 431 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 NPC1O15118 1278 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 LATS1O95835 1130 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CDK17Q00537 523 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CREB5Q02930 508 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PDCLQ13371 301 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ADGRF1Q5T601 910 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 EMC10Q5UCC4 262 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KBTBD6Q86V97 674 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CPXM2Q8N436 756 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 STK32AQ8WU08 396 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 INVSQ9Y283 1065 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PATJQ8NI35 1801 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 OBSL1O75147 1896 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MYH10P35580 1976 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CEP250Q9BV73 2442 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 A0A0A0MRY4 1105 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 E5RJQ4 531 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 IRAK2O43187 625 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TIMM44O43615 452 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 GREM1O60565 184 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TBL1XO60907 577 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KLKB1P03952 638 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SLC2A3P11169 496 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ACADMP11310 421 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KCNA4P22459 653 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 GPD2P43304 727 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MYL5Q02045 173 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CDH18Q13634 790 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SYCP1Q15431 976 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PKDCCQ504Y2 493 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FYB2Q5VWT5 728 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 IL31Q6EBC2 164 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ADAM32Q8TC27 787 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SHC3Q92529 594 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SPAG5Q96R06 1193 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 VPS16Q9H269 839 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 COX16Q9P0S2 106 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms