RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.97□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 EPHB2P29323 1055 aa7.96□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.96□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.96□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 FAM13AO94988 1023 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 TYMPP19971 482 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 PDXDC1Q6P996 788 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TIFAQ96CG3 184 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NLRP4Q96MN2 994 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CCT7Q99832 543 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RNF39Q9H2S5 420 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.96□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.96□□□□□ -1.14
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USP4-211ENST00000485450 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 HOXA9P31269 272 aa7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PBX2P40425 430 aa7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CCR3P51677 355 aa7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 KCNMA1Q12791 1236 aa7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ITGA9Q13797 1035 aa7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SLC29A2Q14542 456 aa7.95□□□□□ -1.14
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