RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 FAM72BQ86X60 149 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 B3GALT6Q96L58 329 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 MARCH5Q9NX47 278 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 H3BRJ5 948 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 SYN3O14994 580 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CREB3O43889 395 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 BANF1O75531 89 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 XRCC4Q13426 336 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 HIF1AQ16665 826 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CROCCP2Q86T23 111 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.54■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 ALOX15BO15296 676 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CXCL10P02778 98 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 PGFP49763 221 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 AIF1P55008 147 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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USP13-202ENST00000482333 DPYSQ14117 519 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 MSS51Q4VC12 460 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CENPUQ71F23 418 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 TAC4Q86UU9 113 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CEP57Q86XR8 500 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 OLFM3Q96PB7 478 aa22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 34.7
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USP13-202ENST00000482333 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 MFSD11O43934 449 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CYP2C18P33260 490 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CXCR3P49682 368 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 IRAK1P51617 712 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 SEMA3BQ13214 749 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 KCNJ11Q14654 390 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 MFSD5Q6N075 450 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 NETO2Q8NC67 525 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 PAK5Q9P286 719 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 DGKIO75912 1065 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 F9P00740 461 aa22.52■■□□□ 1.2
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USP13-202ENST00000482333 PBX3P40426 434 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 PPP2R2AP63151 447 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 GNGT1P63211 74 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 PPARDQ03181 441 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 TLE2Q04725 743 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 TRIM60Q495X7 471 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 RFX8Q6ZV50 586 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 STKLD1Q8NE28 680 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.52■■□□□ 1.2
USP13-202ENST00000482333 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 TCEA3O75764 348 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 ABHD2P08910 425 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 GPR15P49685 360 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 ARL4CP56559 192 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 GUCY1A3Q02108 690 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.51■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 AGTP01019 485 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 FGFR3P22607 806 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 ACTN2P35609 894 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 BEND5Q7L4P6 421 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 SCD5Q86SK9 330 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 TTC25Q96NG3 672 aa22.5■■□□□ 1.19
USP13-202ENST00000482333 SERPINB12Q96P63 405 aa22.5■■□□□ 1.19
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