RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 PATE3B3GLJ2 98 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 BIN1O00499 593 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 NDUFV2P19404 249 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 BMP6P22004 513 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CAMK4Q16566 473 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CPXM2Q8N436 756 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 P2RY11Q96G91 374 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 RAD54BQ9Y620 910 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 E7ENQ6 273 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 M0QYV0 167 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 GFRA2O00451 464 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 TM4SF5O14894 197 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 P4HA2O15460 535 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 AP5Z1O43299 807 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 GNA14O95837 355 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 LCP1P13796 627 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 DPP6P42658 865 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 PTGER3P43115 390 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 MFAP3P55082 362 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 STX17P56962 302 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 PAK1Q13153 545 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 STILQ15468 1287 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 DDI1Q8WTU0 396 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 TFAP2BQ92481 460 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 EDEM1Q92611 657 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 KAT5Q92993 513 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 C4orf47A7E2U8 309 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF217O75362 1048 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 RGS7P49802 495 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 DAOAP59103 153 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 GCNT1Q02742 428 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 STARD3Q14849 445 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 GEN1Q17RS7 908 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 PKDCCQ504Y2 493 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 RRAGAQ7L523 313 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SYT12Q8IV01 421 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SCML4Q8N228 414 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 LMO3Q8TAP4 145 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 UCMAQ8WVF2 138 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CD248Q9HCU0 757 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 WASH3PC4AMC7 463 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 NPC1O15118 1278 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 KCNH2Q12809 1159 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 E2F5Q15329 346 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CNGA2Q16280 664 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 MPPE1Q53F39 396 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 PMF1Q6P1K2 205 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms