RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SUMO3-206	ENST00000479153	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SUMO3-206	ENST00000479153	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SUMO3-206	ENST00000479153	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SUMO3-206	ENST00000479153	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SUMO3-206	ENST00000479153	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	STC2	O76061	302 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	HDAC4	P56524	1084 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	MTA2	O94776	668 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	MOCS3	O95396	460 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF77	Q15935	545 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT86	O43790	486 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	LRCH4	O75427	683 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF8	O76064	485 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ENDOD1	O94919	500 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	F9	P00740	461 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	KLKB1	P03952	638 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TCF4	P15884	667 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	DES	P17661	470 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	WEE1	P30291	646 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	USP4	Q13107	963 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	GRM2	Q14416	872 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	PLD4	Q96BZ4	506 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TRIO	O75962	3097 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	PROSC	O94903	275 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	APOE	P02649	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ASGR2	P07307	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TNNT1	P13805	278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	MIP	P30301	263 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	CCR1	P32246	355 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	GGCX	P38435	758 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	CXCR3	P49682	368 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	NNT	Q13423	1086 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	HTR4	Q13639	388 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
SUMO3-206	ENST00000479153	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23

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