RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 USP3Q9Y6I4 520 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CEP250Q9BV73 2442 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KRBA1A5PL33 1030 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF487B1APH4 448 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KCNK3O14649 394 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 NDC80O14777 642 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PRPSAP2O60256 369 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ATP2C2O75185 946 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ABLIM3O94929 683 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TJP3O95049 919 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 FGF19O95750 216 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ABL1P00519 1130 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CFHP08603 1231 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CSH1P0DML2 217 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CSH2P0DML3 217 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RALAP11233 206 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SRFP11831 508 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LCP1P13796 627 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC130P13994 396 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CPB1P15086 417 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PFKLP17858 780 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 BDNFP23560 247 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 HTR7P34969 479 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PEX5P50542 639 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 AMPD2Q01433 879 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LMNB2Q03252 620 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 VEPH1Q14D04 833 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PSMD5Q16401 504 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TAF12Q16514 161 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TTC13Q8NBP0 860 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TEKT4Q8WW24 435 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 UBXN4Q92575 508 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CD101Q93033 1021 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MYLPFQ96A32 169 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 HINFPQ9BQA5 517 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PRR14Q9BWN1 585 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KRT82Q9NSB4 513 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SCML2Q9UQR0 700 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 R4GN57 208 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 FAM92AA1XBS5 289 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 I3L4J1 428 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ENC1O14682 589 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CEP104O60308 925 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LILRB3O75022 631 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 FTCDO95954 541 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ADH1AP07327 375 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SP9P0CG40 484 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SDHBP21912 280 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 YWHAQP27348 245 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 OR1D2P34982 312 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PTPN7P35236 360 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 EPHB3P54753 998 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 DAOAP59103 153 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ORC1Q13415 861 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TFDP2Q14188 446 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ERMARDQ5T6L9 678 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms