RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	MTAP	Q13126	283 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CCIN	Q13939	588 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	GAB4	Q2WGN9	574 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZS52	159 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	BEND5	Q7L4P6	421 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TAC4	Q86UU9	113 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PNKP	Q96T60	521 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CHRD	Q9H2X0	955 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PLK2	Q9NYY3	685 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	COX16	Q9P0S2	106 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CBFA2T2	O43439	604 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CYBB	P04839	570 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	APOD	P05090	189 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TNFAIP3	P21580	790 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SLC11A2	P49281	568 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	C12orf40	Q86WS4	652 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	RNF34	Q969K3	372 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DEC1	Q9P2X7	70 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		18.48	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN3	O60637	253 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TULP3	O75386	442 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	GBP1	P32455	592 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	GABRB2	P47870	512 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SEC13	P55735	322 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	XYLT1	Q86Y38	959 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DDI1	Q8WTU0	396 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DDIT4	Q9NX09	232 aa		18.47	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DMD	P11532	3685 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	GFRA3	O60609	400 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	RNF40	O75150	1001 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DAB1	O75553	588 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	KAT7	O95251	611 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	IGLV3-27	P01718	113 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	APOE	P02649	317 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NOS2	P35228	1153 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PBX1	P40424	430 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	RING1	Q06587	406 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NME3	Q13232	169 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FBXO43	Q4G163	708 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FIGN	Q5HY92	759 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ADGRF1	Q5T601	910 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CPXM2	Q8N436	756 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	IER2	Q9BTL4	223 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	MARK1	Q9P0L2	795 aa		18.46	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902		M0QYT0	321 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	IRAK2	O43187	625 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ACSL4	O60488	711 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	LATS1	O95835	1130 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	MMP8	P22894	467 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	GRIA2	P42262	883 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	MATK	P42679	507 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CXCL12	P48061	93 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	NNT	Q13423	1086 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	GAS6	Q14393	721 aa		18.45	■□□□□ 0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms