RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 HHLA1C9JL84 531 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 M0QYT0 321 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 TM9SF1O15321 606 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 INPPL1O15357 1258 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 SUN1O94901 812 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 FYNP06241 537 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 CTSHP09668 335 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 MLNP12872 115 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 PRKCHP24723 683 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 FDFT1P37268 417 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 GLUD2P49448 558 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 NDUFV1P49821 464 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 MAP3K7CLP57077 242 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 MTFR1Q15390 333 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 FAM171BQ6P995 826 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 MICALL1Q8N3F8 863 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 GDAP1Q8TB36 358 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 RNF139Q8WU17 664 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 HTR3CQ8WXA8 447 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 IRGQQ8WZA9 623 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 APBB2Q92870 758 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 ACBD6Q9BR61 282 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 PADI3Q9ULW8 664 aa18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
LMO2-204ENST00000464025 A0A0A0MRY4 1105 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 A0A1W2PPM1 405 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 AP1G2O75843 785 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 METTL18O95568 372 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ASGR1P07306 291 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ODC1P11926 461 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 FOXN2P32314 431 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ADRA1BP35368 520 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SCNN1GP51170 649 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 DEUP1Q05D60 604 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SEMA3BQ13214 749 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PTK7Q13308 1070 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 DPYSQ14117 519 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PDK4Q16654 411 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 CNPY4Q8N129 248 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 LPPQ93052 612 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PGBD4Q96DM1 585 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 UROC1Q96N76 676 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SPATA13Q96N96 652 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 DSEQ9UL01 958 aa18.08■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PTPRDP23468 1912 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 M0QZQ0 153 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 NRP1O14786 923 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SPAG7O75391 227 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 F9P00740 461 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 APRTP07741 180 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 KRT4P19013 534 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 CA4P22748 312 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 GRIK3Q13003 919 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PDK1Q15118 436 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ZNF534Q76KX8 674 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 BEND5Q7L4P6 421 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SPATA21Q7Z572 469 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 BANPQ8N9N5 519 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 STARD13Q9Y3M8 1113 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.07■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.06■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 DNM1LO00429 736 aa18.06■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 DCLK1O15075 740 aa18.06■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 OPHN1O60890 802 aa18.06■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 INHBAP08476 426 aa18.06■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 THPOP40225 353 aa18.06■□□□□ 0.48
LMO2-204ENST00000464025 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms